sábado, 31 de março de 2012

Música sobre o glucagon

Mais uma música do Dr. Ahern (www.davincipress.com/metabmelodies.html), desta vez baseada na famosa música de Natal Santa Claus is coming to town.

http://www.mediafire.com/?tdsvic69xyww38h 

Glucagon is Coming Around

Instructor sings
You've gotta admire
What molecules do
Their cellular fire
Is ready on cue
Glucagon is coming around

Whenever it binds
Receptor outside
G protein finds
G nucleotides
Glucagon is coming around

Everyone sings
They activate cyclases
That make cAMPs
Which bind to protein kinases
And pull the R's from C's

Instructor sings
The glycogen shrinks
In liver quite fast
The glucose into
The bloodstream is passed
Thanks to this you have energy

Your muscles uptake
The glucose in turn
Obtaining a substrate
That all of them burn
Thanks to this you have energy

Everyone sings
The pool of phosphatidyl
Inositides in you
Can send two separate signals
When they get split in two

Instructor sings
The IP3 sets
The calcium free
Turning on
Protein Kinase C
And it happens so easily

The muscles contract
When calcium's free
Lowering levels
Of Creatine-P
And it happens so easily

Everyone sings
Those little calcium ions
I hope you've learned them well
Are just like Martha Stewart
All locked up in a cell

Instructor sings
This story's complete
I know it's a load
My hope is your head
Ain't gonna explode
You will really need it next week
.

segunda-feira, 26 de março de 2012

Frase célebre (8)

Apesar de poderem existir várias formas de estar vivo, há de certeza muito 
mais formas de morrer.

domingo, 11 de março de 2012

Regulação da oxidação do piruvato (parte 2)

A atividade do complexo piruvato desidrogenase é regulada essencialmente através de 2 mecanismos distintos - alosteria e modificação covalente reversível.
De facto, existem alguns moduladores alostéricos deste complexo, que, neste caso concreto pertencem à classe dos moduladores negativos, ou seja, inibidores da atividade catalítica:
- acetil-CoA – sendo o produto da reação, faz todo o sentido que a molécula de acetil-CoA tenha um efeito inibitório sobre a sua própria síntese
- NADH – um dos produtos da reação é o NADH, portanto o raciocínio é equivalente ao efetuado em cima para a acetil-CoA. Além disso, e conforme já foi referido noutros posts aqui do blog, o NADH pode estar envolvido na síntese de ATP (através da respiração celular), pelo que a sua presença indica um potencial estado energético em alta dentro da célula. Nesse sentido, e como a oxidação do piruvato a acetil-CoA faz parte do catabolismo, cujo principal objetivo é a obtenção de energia, faz sentido que o NADH inibe o catabolismo e, em particular, esta reação.

Em relação à modificação covalente reversível, este complexo enzimático é inibido por fosforilação e ativado por desfosforilação. Este processo é mediado por 2 enzimas diferentes… A que fosforila designa-se por piruvato desidrogenase cinase, enquanto que a que desfosforila chama-se piruvato desidrogenase fosfatase.
Fatores que ativam a cinase, levando à fosforilação do complexo piruvato desidrogenase (ou seja, inibidores da sua atividade catalítica):
- acetil-CoA e NADH – além do seu efeito direto no complexo piruvato desidrogenase, como inibidores alostéricos, estas duas moléculas ativam também a fosforilação do mesmo, promovendo a sua inibição, portanto, através de 2 mecanismos distintos

Fatores que inibem a cinase, favorecendo no equilíbrio a forma desfosforilada do complexo piruvato desidrogenase (ou seja, ativadores da sua atividade catalítica):
- NAD+ – em relação a esta molécula pode fazer-se o raciocínio inverso ao efetuado para o NADH. Ou seja, a presença de NAD+ indica um défice energético da célula, pelo que será necessário ativar o catabolismo para contrariar esse défice.
- ADP – o raciocínio é equivalente ao anterior, pois dizer-se que a célula está a acumular ADP significa dizer que está a gastar ATP, ou seja, vai necessitar de produzir novamente ATP
- piruvato – o piruvato é o substrato da reação, sendo que a sua presença vai ativar o complexo piruvato desidrogenase através da inibição do processo de fosforilação (e, consequentemente, inibição) do complexo piruvato desidrogenase
- coenzima A (CoA) – este cofator tem um papel de co-substrato, pelo que a sua presença vai afetar a atividade catalítica do complexo de forma idêntica à descrita para o piruvato

Fatores que ativam a fosfatase, levando à desfosforilação do complexo piruvato desidrogenase (ou seja, ativadores da sua atividade catalítica):
- Ca2+ – o ião cálcio é um modulador importantíssimo do nosso metabolismo. Neste caso em concreto, este ião atua (no músculo) ao nível da piruvato desidrogenase fosfatase, ativando-o, através da promoção da sua desfosforilação. De uma forma simples, o ião cálcio é um indicador da contração muscular, pelo que faz todo o sentido que num contexto de trabalho muscular o catabolismo esteja ativo, de forma a haver ATP disponível para esse processo

quinta-feira, 8 de março de 2012

Música sobre as prostaglandinas

A canção Oklahoma! inspirou o Dr. Ahern (www.davincipress.com/metabmelodies.html) a criar uma música sobre as prostaglandinas... :)

http://www.mediafire.com/?c3n25wp37xorw31

Prostaglandins

Prossss-taglandins
The ei-co-sa-noids creating pain
Are the ones to blame - when you get inflamed
And ouch(!) - they hurt inside your brain

Prossss-taglandins
Every throb and ache gets magnified
If you hope to win, cyclo-oxygen's
Generation's got to be denied

The Vioxx has all been recalled
So go get yourself Tylenol-ed
And if you aaaaaaaaaaaaache
Blame PGH synthaaaaaaaaase!

We must complain that
You make the aches prostaglandins
Prostaglandin - D2, F1, G2, E2
Prostaglandin, it's you
.

sábado, 3 de março de 2012

Piadas científicas (16)

Qual é o som que faz um átomo quando arrota?
Boooooooohr.

E quando cai ao chão?
Planck!
.